解:(1)當(dāng)x=0時,y=4,即B(0,4),
當(dāng)y=0時,x=4,即A(4,0),
∵拋物線上有不同的兩點E(k+3,-k
2+1)和F(-k-1,-k
2+1)的縱坐標(biāo)相等,
∴點E和點F關(guān)于拋物線對稱軸對稱,
∴對稱軸x=-

=

=1,
把點A,點B代入拋物線解析式中求得a=

,b=1,c=4,
∴拋物線解析式為y=-

x
2+x+4;
(2)當(dāng)點P(x,x)在直線AB上時,x=-x+4,
解得x=2,
當(dāng)點Q(

,

)在直線AB上時,

=-

+4,
解得x=4.
所以,若正方形PEQF與直線AB有公共點,則2≤x≤4.

(3)當(dāng)點E(x,

)在直線AB上時,(此時點F也在直線AB上)

=-x+4,
解得x=

.
①當(dāng)2≤x<

時,直線AB分別與PE、PF有交點,設(shè)交點分別為C、D,
此時,PC=x-(-x+4)=2x-4,
又PD=PC,
所以S
△PCD=

PC
2=2(x-2)
2,
從而:S=

x
2-2(x-2)
2=-

x
2+8x-8=-

(x-

)
2+

.
∵2≤

<

,
∴當(dāng)x=

時,S
max=

.

②當(dāng)

≤x≤4時,直線AB分別與QE、QF有交點,設(shè)交點分別為M、N,
此時,QN=(-

+4)-

=-x+4,
又QM=QN,
∴S
△QMN=

QN
2=

(x-4)
2,
即S=

(x-4)
2.
其中當(dāng)x=

時,S
max=

.
綜合①②得,當(dāng)x=

時,S
max=

.
分析:(1)由直線y=-x+4交x軸的正半軸于點A,交y軸于點B,即可求得A,B的坐標(biāo),又由拋物線上有不同的兩點E(k+3,-k
2+1)和F(-k-1,-k
2+1)的縱坐標(biāo)相等,即可求得此拋物線的對稱軸,利用待定系數(shù)法即可求得解析式;
(2)分別從當(dāng)點P(x,x)在直線AB上時與當(dāng)點Q(

,

)在直線AB上時分析,即可求得x的取值范圍;
(3)首先求得當(dāng)點E(x,

)在直線AB上時x的值,再分別從當(dāng)2≤x<

時與當(dāng)

≤x≤4時去分析,注意三角形的面積求解方法與二次函數(shù)最大值的求解方法的應(yīng)用.
點評:此題考查了待定系數(shù)法求二次函數(shù)的解析式,函數(shù)自變量的取值范圍的確定、二次函數(shù)最大值的確定以及三角形面積的求解等知識.此題綜合性很強,注意數(shù)形結(jié)合思想與分類討論思想的應(yīng)用.